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行政院衛生署成立「食品藥物管理局（TFDA）」 為協助產業發展，調和區域法規以及提升行政作業效率與審查透明化，行政院衛生署參考先進國家藥物食品管理組織體例，研擬成立「食品藥物管理局（TFDA）」，並於98年5月12日立法院院會通過「行政院衛生署食品藥物管理局組織法」三讀。
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