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2001 改名為「台灣動物科技研究所」，進行多元化發展。 2003 新建行政與研究大樓落成。 2004 成立創新育成中心，協助產業發展。 2007 獲得認證，成為全國第一家由研究單位成立之家畜產品驗證機構。 2007 榮獲經濟部中小企業處96年度最佳特色績優育成中心獎項。

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台灣動物科技研究所創新育成中心 | Facebook
台灣動物科技研究所創新育成中心. 26 likes · 0 talking about this. 動科所育成中心的願景是成為六心級亞洲動物科技創新育成中心，本著細心、耐心、愛心、專心、以科技創新為核心和創業的心，提供國內外創新創業的加值服務，協助中小企業與科技創業人員 ...

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台灣動物科技研究所劉昌宇博士：優質禽畜生產技術-中華生物資源應用協會「糧與食安全」技術發表大會 - YouTube
台灣動物科技研究所劉昌宇博士：優質禽畜生產技術-中華生物資源應用協會「糧與食安全 ­」技術發表大會 http://www.cbaa.org.tw/

央廣新聞 - 央廣行動網
農委會主委陳保基(陳林幸虹 攝) 狂犬病疫情累計12例山區鼬獾確診，專家建議山區空投基因重組載體疫苗防疫，行政院農業委員會主委陳保基說，評估後再決定。 台灣動物科技研究所所長楊平政接受電訪指出，美國自1992年起

台灣淪陷 李惠仁：農委會竟只向OIE通報「類」狂犬病 | ETtoday政治新聞 | ETtoday 新聞雲
公民導演李惠仁。(圖／記者陳佳雯攝) 記者陳佳雯／台北報導 公民導演李惠仁25日受訪時表示，農委會竟用「Lyssavirus(麗沙病毒)」向OIE通報，而不是用狂犬病名義通報。並說，農委會將防疫的監測工作將交台灣動物科技研究所